职位详情
肠道微生态专职人员
6000-10000元
圣艾科技(山西)有限公司
太原
3-5年
硕士
10-21
工作地址

华润大厦-T7栋26层

职位描述

需要一位“既能独立开发新脚本、又能按时交报告”

1、英语读写无障碍,生物学、微生物学、生物信息学、医学等相关专业。

2、具有完整的微生物组学项目实战(16S、宏基因组、代谢组),课题或正式工作均可计入;

3、累计处理样本数≥100例或测序数据≥500 Gb。

4、编程与流程:熟练掌握R/Python/C++/Shell/Perl/Script语言,能随手改脚本;熟悉Snakemake或Nextflow加分;

5、组学分析:从原始fastq到物种/功能注释、差异统计、可视化,一条龙独立跑通;知道质控陷阱(宿主污染、批次效应)并能现场解决;

6、数据库与系统:熟练操作Linux集群,能在命令行完成blast、KEGG、eggNOG注释;熟悉NCBI/GMrepo/EBI等微生物组学数据库的使用。

7、 实验衔接与生物学翻译

(1)至少知道粪便样本采集、DNA提取、PCR抑制因子清除等基本湿实验痛点,能和实验同事对上话;

(2)能把“LEfSe柱状图”翻译成例如“某菌产丁酸可能通过GPR43改善胰岛素敏感性”这类客户/医生听得懂的机制假设。

8、 交付与输出标准

(1)接到数据后≤5个工作日输出标准分析报告(含方法、图表、结论、方法学局限);

(2)报告模板可自动生成(R Markdown或Python Notebook),一键导出PDF/PPT;

(3)能根据客户追问快速做个性化挖掘(ROC、随机森林、WGCNA、多组学关联),不排斥“再来一遍”的迭代。

9、学术/产业影响力(同等加分)

(1)以第一或共一发表过微生物组SCI,或署名发明专利/软件著作权≥1项;

(2)熟悉临床样本管理和IVD申报流程,能写注册用生信部分资料;

(3)有粪菌移植、益生菌/活体生物药项目经验,知道GMP级别数据分析要求。

以担保或任何理由索取财物,扣押证照,均涉嫌违法,请提高警惕

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