职位描述
一、岗位基本信息
1. 岗位名称:高级数据科学经理
2. 所属部门:转化医学部
3. 汇报对象:高级医学总监
4. 下属团队:生物信息学分析团队(3 人)
5. 工作地点:上海
6. 岗位类型:管理 + 技术双驱动型(70% 技术深度主导,30% 团队管理)
7. 核心定位:聚焦肿瘤 NGS 科研项目的生物信息学全流程设计、技术突破与团队能力建设,支撑公司在肿瘤分子分型,微小残留病灶,预后耐药模型构建等领域的科研创新与成果转化。
二、核心岗位职责
(一)科研项目生物信息学全流程主导
1. 牵头肿瘤 NGS 科研项目的生物信息学方案设计,包括但不限于肿瘤ctDNA 低丰度变异检测(如 0.1% 以下 VAF)、肿瘤微环境(TME)单细胞测序分析、甲基化测序(WGBS/EPIC)数据解读、多组学(基因组 + 转录组 + 蛋白组)联合分析等,确保方案符合科研目标(如 Nature/Science 子刊级论文发表、大型科研基金申报)及行业技术标准。
2. 主导复杂生物信息学数据分析与解读:针对肿瘤 NGS 高通量数据(WGS/WES/Panel/ 单细胞 RNA-seq),设计个性化分析流程(如基于 GATK/Mutect2 的变异检测流程、基于 Seurat/Monocle 的单细胞分群流程),解决低丰度变异假阳性过滤、肿瘤异质性解析、跨平台数据一致性校验等核心技术难题。
3. 推动科研成果转化:将生物信息学分析成果转化为可落地的技术方案或产品雏形,支撑公司与三甲医院、科研院校的合作项目(如肿瘤多中心临床研究、重大专项),确保项目按时交付并达到预期科研指标。
(二)团队管理与能力建设
1. 负责生物信息学分析团队的搭建、培养与绩效管理:制定团队成员的能力发展计划(如肿瘤 NGS 专项技术培训、科研论文写作指导),定期组织内部技术分享(如最新变异检测算法、多组学分析思路),提升团队在肿瘤生物信息学领域的技术深度与科研思维。
2. 建立团队工作标准与质量管控体系:制定肿瘤 NGS 科研数据的分析 SOP(含数据质控、流程标准化、结果验证),搭建数据质量监控平台(如 FastQC/Qualimap 自动化质控报告),确保分析结果的准确性(如与数字 PCR 验证结果一致性≥95%)与可重复性。
(三)技术创新与行业协作
1. 跟踪肿瘤 NGS 与生物信息学领域的前沿技术动态(如 AI 驱动的变异致病性预测、单细胞空间转录组分析技术),主导技术预研项目(如基于大语言模型的科研数据解读工具开发),推动公司在生物信息学技术上的核心竞争力构建。
2. 牵头医学部部门内协作:与医学科学家、项目运营组、区域医学事务紧密配合,解决跨部门项目中的生物信息学技术痛点,保障项目顺利推进。
3. 参与科研成果输出:主导或参与肿瘤 NGS 领域的科研论文撰写(影响因子≥5 分优先)、专利申报(生物信息学算法或分析流程相关专利),提升公司在行业内的科研影响力。
三、任职要求
(一)学历与专业背景
1. 博士学历,生物信息学、计算生物学、基因组学、肿瘤学、统计学等相关专业;或硕士学历 + 5 年以上肿瘤 NGS 领域生物信息学科研分析经验(需有大型级科研项目主导经历)。
2. 具备扎实的肿瘤分子生物学基础,深入理解肿瘤发生发展的分子机制(如驱动基因突变、肿瘤微环境调控),熟悉肿瘤 NGS 检测技术原理(如 WGS/WES/ctDNA Panel / 单细胞测序)。
(二)核心技术能力
1. 熟练掌握肿瘤 NGS 科研数据的全流程分析工具与算法:
1. 数据处理:熟练使用 BWA/SOAPaligner 进行序列比对,GATK/Mutect2/VarScan2 进行变异检测,CNVkit/Control-FREEC 进行拷贝数变异分析,STAR/TopHat+Cufflinks 进行基因表达定量。
2. 高级分析:具备单细胞测序分析(Seurat/Scrublet/Monocle)、甲基化分析(Bismark/DSS)、多组学联合分析(WGCNA/PLS-DA)、AI 算法应用(如基于 TensorFlow/PyTorch 的变异预测模型)经验者优先。
3. 编程与工具:精通 Python(Pandas/Numpy/Scikit-learn)、R(dplyr/ggplot2)编程,熟练使用 Linux 系统及 Shell 脚本,具备 Docker 容器化部署或云计算平台(AWS/GCP/ 阿里云)使用经验。
4. 有核心技术突破案例:曾主导或核心参与肿瘤 NGS 科研项目的生物信息学技术攻关(如解决低丰度 ctDNA 变异检测假阳性问题、开发肿瘤异质性分析算法),并形成可验证的技术成果(如论文、专利、软件著作权)。
(三)项目与团队管理经验
1. 3年以上生物信息学团队管理经验(带团队规模≥2 人),具备科研项目全周期管理能力:曾主导大型科研项目(如国家自然科学基金、“十四五” 重大专项)或国际合作项目的生物信息学模块,能独立制定项目计划、分配资源、管控风险,确保项目按时交付。
2. 具备优秀的跨部门协作能力:有与医院临床科室、科研院校(如中科院 / 高校实验室)、测序平台团队协作的经验,能清晰理解跨领域需求并转化为生物信息学解决方案。
(四)软技能与职业素养
1. 科研思维与创新能力:具备敏锐的科研洞察力,能从肿瘤临床需求中挖掘科研方向,提出创新性的生物信息学分析思路(如基于多组学数据构建肿瘤预后预测模型)。
2. 沟通与表达能力:能清晰向非技术团队(如临床医生、科研合作方)解读生物信息学分析结果,具备科研论文(SCI)或项目报告的撰写与汇报能力。
3. 责任心与抗压能力:能适应肿瘤 NGS 科研项目的高强度节奏(如紧急科研数据解读、论文投稿冲刺),对技术细节有追求,确保分析结果的严谨性。
以担保或任何理由索取财物,扣押证照,均涉嫌违法,请提高警惕