肿瘤多组学数据分析与报告生成

• 主导实体肿瘤及外周血样本的全外显子测序（WES）、转录组测序及免疫微环境多组学数据分析，构建肿瘤基因组文库

• 完成体细胞基因变异、HRD（同源重组缺陷）、DDR通路基因（体细胞/胚系突变）的精准检测及功能注释

• 开发免疫治疗适用性评估体系，整合TMB、MSI、HLA-I分型、ITH、肿瘤新抗原预测等核心指标分析

• 设计化疗敏感性SNP位点与TCR免疫组库多样性的关联分析模型，输出临床级个性化诊疗报告（含专业医学解读）

新生抗原预测算法开发与数据库构建

• 设计并优化肿瘤新生抗原预测算法，重点突破HLA-peptide结合亲和力预测及抗原免疫原性评估模型

• 建立多维度新生抗原筛选标准，整合基因组变异、转录组表达量及质谱验证数据

• 搭建肿瘤新生抗原知识数据库，实现HLA分型、TCR序列、抗原表位等数据的结构化存储与智能检索

• 与湿实验团队协作，验证算法预测结果与体外免疫激活实验的相关性

基础要求

• 生物信息学、计算生物学、基因组学或相关专业硕士及以上学历

• 精通肿瘤多组学数据分析流程，具备WES/WGS、RNA-seq、免疫组化数据实战经验

• 熟练掌握Python/R语言，熟悉GATK、STAR、ANNOVAR等生信工具，熟悉TCGA/ICGC等公共数据库

• 熟悉肿瘤免疫治疗核心指标（PD-L1、TIL、TMB等）及新生抗原预测原理（如NetMHCpan、MHCflurry）

优先条件