岗位职责

1. 负责单细胞组学与空间转录组学数据分析流程的研发、维护和优化，包括但不限于scRNA-seq/snRNA-seq、scATAC-seq、单细胞多组学（RNA+ATAC/CITE-seq等）、空间转录组（10x Visium HD、Stereo-seq等）、单细胞全长转录组和空间全长转录组；

2. 独立完成项目所需的分析与交付：数据质控与去噪、去双ts、批次矫正/整合、聚类与细胞类型注释、差异分析、轨迹/拟时序、细胞通讯、空间域识别与空间差异表达、空间去卷积（deconvolution）及空间可视化等，并撰写SOP与项目报告；

3. 将成熟流程进行标准化封装与自动化（如Nextflow/Snakemake等），部署到服务器/HPC/平台并完成测试、版本管理与可复现性保障；

4. 跟踪单细胞与空间组学领域的文献、算法和工具进展，结合项目目标提供更优的分析方案与可解释的生物学结论。

岗位要求：

1. 生物信息、计算生物学、生物学、医学等相关专业硕士及以上学历；有单细胞组学/空间转录组项目经验者优先；

2. 熟悉单细胞与空间转录组常用分析方法与工具生态（如Seurat/Scanpy、Cell Ranger/STARsolo、Space Ranger、wf-single-cell及相关空间分析工具等），可独立完成端到端分析；

3. 熟练使用R或Python进行数据处理、统计分析与可视化；熟悉Linux环境、脚本编写与常用生信工具链；

4. 有流程化/工程化经验者优先：Snakemake/Nextflow/WDL，Docker/Singularity，Git，HPC任务调度（Slurm/PBS等），以及良好的结果复现与交付意识；

5. 具备非模式动物或植物细胞注释相关经验，熟悉非模式物种基因组特征，能独立完成基于单细胞数据的物种特异性细胞类型注释工作；

6. 具备良好的沟通协作能力、问题定位能力和学习能力，能推动跨团队项目按期高质量交付。