职位详情
生信工程师
1.3-1.8万
深圳市芭田生态工程股份有限公司
深圳
1-3年
硕士
09-26
工作地址

深圳市芭田生态工程股份有限公司(松岗分公司)

职位描述
岗位职责:
1、搭建微生物代谢模型构建、FBA 分析、机器学习建模的自动化流程(基于 Python/Shell 脚本),编写SOP 文档
2、负责实验数据(如菌株促生数据、田间降解数据)、模型文件、分析结果的归档管理,撰写项目分析报告,向研发团队同步模型预测结论及田间应用建议。​
3、与实验团队协作明确模型校正需求;优化菌株与作物的互作代谢模型;配合 AI 算法团队优化农业场景下的模型输入特征。​
4、跟踪代谢建模前沿技术(如新型农业微生物 GEM 重构算法、AI 驱动的作物 - 微生物互作模型),评估并引入适配工具(如耐逆菌株代谢模型专用插件、农业多组学数据整合工具)。
岗位要求:
1、硕士及以上学历,生物信息学、计算生物学、农业生物技术、微生物学、生物工程等相关专业;1-3 年生物信息学相关工作经验,至少 1 年农业微生物代谢模型构建或多组学分析经验;应届生需具备农业微生物 GEM/FBA 相关毕业设计或科研项目经验。
2、熟练基因组尺度代谢模型(GEM)构建方法,有农业微生物(如根瘤菌、芽孢杆菌、降解菌)GEM 构建经验者优先,能独立使用 COBRApy、ModelSEED 等工具,熟悉 SBML 模型格式及农业微生物专属数据库(如 Rhizobase、AGRICOLA)。​
3、掌握通量平衡分析(FBA)原理与操作,能使用 Gurobi/GLPK 执行 FBA 计算,有农业场景下 FBA 应用经验(如生物肥料菌株代谢优化、秸秆降解菌通量分析)者优先。​
4、具备机器学习建模能力,熟练使用 Scikit-learn、TensorFlow/PyTorch 构建随机森林、神经网络模型,能处理农业多组学数据(如根际微生物组、土壤代谢组),有农业功能预测模型开发经验者优先。​
5、熟练使用 Python(Pandas、NumPy、Matplotlib)、R 等数据分析工具,具备 Shell 脚本编写能力,能搭建自动化分析流程;熟悉 Linux 操作系统,有高通量测序数据分析经验者优先。
6、了解理性设计 AI 技术(如强化学习)在微生物改造中的应用,能参与改造方案的 AI 设计与验证

以担保或任何理由索取财物,扣押证照,均涉嫌违法,请提高警惕

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